Ege Perinatoloji Derneği 16 Aralık 1994 tarihinde Kadın Hastalıkları ve Doğum Uzmanları, Pediatri Uzmanları ve Genetik Uzmanlarınca multidisipliner bir anlayışla kurulmuş, ilk yönetim kurulu Doç. Dr. Nurettin Demir başkanlığında, Doç. Dr. Ferda Özkınay, Doç. Dr. Namık Demir, Uz. Dr. Resmiye Oral ve Doç. Dr. Ali Baloğlu’ndan oluşmuştur.
26 Ocak 1995 yılında yapılan ilk Genel Kurul’un ardından Doç. Dr. Nurettin Demir başkanlığa , Doç. Dr. Ferda Özkınay, Doç. Dr. Namık Demir, Prof. Dr. Nilgün Kültürsay, Op. Dr. Hakan Kanıt ise yönetim kurulu üyeliklerine seçilmişlerdir. Bu tarihten itibaren Olgu Sunumu Toplantıları, panel ve kurslar düzenlenmiş, perinatoloji alanında ortak bilgi alışverişinin sağlanması, disiplinler arası işbirliğinin geliştirilmesi ve bu alana ilgi duyan meslektaşlarımızın bilgi, görgü ve deneyiminin arttırılması için aralıksız çalışılmıştır.
23.01.1997 tarihinde yapılan Genel Kurul Toplantısı’nda Yönetim Kurulu Asil Üyeleri Nurettin Demir ( Başkan), Hasan Özkan, Nilgün Kültürsay, Ferda Özkınay, Hakan Kanıt, Yönetim Kurulu Yedek Üyeleri Bülent Uran, Ahmet Seçkin Önoğlu, Işın Yaprak, Resmiye Oral, Erdal Yermez, Denetleme Kurulu Asil Üyeleri İsrael Aruh, İncim Bezircioğlu, Nermin Tansug, Denetleme Kurulu Yedek Üyeleri Namık Demir, Ertürk Levent, Tevfik Yoldemir olarak belirlenmiştir.
17.07.2000 tarihinde yapılan Genel Kurul’da Yönetim Kurulu Asil Üyeleri Ferda Özkınay ( Başkan), Nilgün Kültürsay, Esen Demir, Işın Yaprak, Sermet Sağol, Yönetim Kurulu Yedek Üyeliklerine Nermin Tansuğ, Ata Erdener, Kemal Öztekin, Yeşim Aydınok, Üzeyir Kırca, Denetleme Kurulu Asil Üyeliklerine Hakan Kanıt, İsrael Aruh, Damla Gökşen, Denetleme Kurulu Yedek Üyeliklerine Hatice Marifet, Ayşe Yenigün, Hasan Özkan seçilmişlerdir.
11 Ekim 2000 tarihinde “ Yeni Binyılda Perinatal Tıpta Gelişmeler” toplantısı düzenlenmiştir. Olgu Sunumu toplantıları devam ettirilmiştir. 18 Mart 2005’te “ Hızlı Prenatal Tanı ve Amniyosentez” toplantısı yapılmıştır.
16.03.2005 tarihinde Yönetim Kurulu Asil Üyeliklerine Hakan Kanıt ( Başkan), Soner Recai Öner, Nermin Tansuğ, Sermet Sağol ve Derya Erçal seçilmişlerdir. 4 Mayıs 2005 tarihinde “ Prematürite Paneli” 12 Ekim 2005’de “Fetal ve Postpartum Enfeksiyonlar Paneli” 23 Şubat 2006’da “ Fetal Ekokardiyografi Paneli” 6 Aralık 2006’da “ Sezeryan Normal Doğum: Malpraktis Açısından Yaklaşım Paneli” düzenlenmiş, Olgu Sunumları’na düzenli olarak devam edilmiştir. 7 Mart 2007’de “Çoğul Gebelikler Paneli”, 25 Haziran 2007’de “Genetik Tarama Paneli” yapılmış ve Olgu Sunumu Toplantıları düzenlenmiştir.
10.08.2009 tarihli Genel Kurul ile Yönetim Kurulu Asil Üyeliklerine Hakan Kanıt ( Başkan), Asude Durmaz, Aslıhan Yılmaz Ekmekçi, Soner Recai Öner, Zehra Mete seçilmişlerdir. 4 kasım 2009’da “ Bebekte Doğum Yaralanmaları: Nedenler ve Sonuçlar Paneli”, 25 Ocak 2010’da “ Geç Tanı Alan Anomaliler Paneli” düzenlenmiştir.
11.05 .2011 tarihli Genel Kurul Toplantısı ile Yönetim Kurulu Asil Üyeleri Yeşim Bülbül ( Başkan), Soner Recai Öner, Aslıhan Ekmekçi, İncim Bezircioğlu, Burak Durmaz olarak belirlenmiştir.
2013 Nisan Genel Kurul Toplantısı ile Yeşim Bülbül (Başkan), Aslıhan Ekmekçi, Ayça Aykut, Mehmet Özeren, Ayşe Özbakkaloğlu Yönetim Kurulu Asil Üyeleri olarak seçilmişlerdir.
Nisan 2015 Genel Kurulu’nda ise Sabahattin Altunyurt (Başkan), H. Gürsoy Pala, Tahir Atik, Özge Köroğlu ve Ayça Aykut Yönetim Kurulu üyeleri seçilmiştir.
Nisan 2017 Yönetim Kurulu: Sabahattin Altunyurt (Başkan), H. Gürsoy Pala, Tahir Atik, Özge Köroğlu ve Erhan Parıltay Asil Üyeleri olarak seçilmişlerdir
Nisan 2019 ve Ağustos 2021 de yapılan genel kurul sonrası seçilen yönetim kurulu: H. Gürsoy Pala (Başkan), Erkan Çağlıyan, Tahir Atik, Özge Köroğlu ve Erhan Parıltay
Haziran 2023 de yapılan genel kurul sonrası yönetim kurulu: Erkan Çağlıyan (Başkan), Tahir Atik, Özge Köroğlu, Erhan Parıltay ve Ezgi Bilicen